定义 质粒(plasmid)是细菌拟核裸露DNA外的遗传物质,为双股闭合环形的DNA,存在于细胞质中,质粒编码非细菌生命所必须的某些生物学性状,如性菌毛、细菌素、毒素和耐药性等。质粒具有可自主复制、传给子代、也可丢失及在细菌之间转移等特性,与细菌的遗传变异有关。
特征
是真核细胞细胞核外或原核生物拟核区外能够进行自主复制的遗传单位,包括真核生物的细胞器(主要指线粒体和叶绿体)中和细菌细胞拟核区以外的环状脱氧核糖核酸(DNA)分子。现在习惯上用来专指细菌(大肠杆菌)、酵母菌和放线菌等生物中细胞核或拟核中的DNA以外的DNA分子。在基因工程中常被用做基因的载体(Vector)。许多细菌除了拟核中的DNA外,还有大量很小的环状DNA分子,这就是(plasmid)(补充:部分为RNA)。上常有抗生素的抗性基因,例如,四环素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。有些称为附加体(episome),这类能够整合进真菌的染色体,也能从整合位置上切离下来成为游离于染色体外的DNA分子。在宿主细胞体内外都可复制!
目前,已发现有的细菌有几百种,已知的绝大多数的细菌都是闭合环状DNA分子(简称cccDNA)。细菌的相对分子质量一般较小,约为细菌染色体的0.5%~3%。根据相对分子质量的大小,大致上可以把分成大小两类:较大一类的相对分子质量是40×106以上,较小一类的相对分子质量是10×106以下(少数的相对分子质量介于两者之间)。每个细胞中的数主要决定于本身的复制特性。按照复制性质,可以把分为两类:一类是严紧型,当细胞染色体复制一次时,也复制一次,每个细胞内只有1~2个;另一类是松弛型,当染色体复制停止后仍然能继续复制,每一个细胞内一般有20个左右。这些的复制是在寄主细胞的松弛控制之下的,每个细胞中含有10-200份拷贝,如果用一定的药物处理抑制寄主蛋白质的合成还会使拷贝数增至几千份。如较早的pBR322即属于松弛型,要经过氯霉素处理才能达到更高拷贝数。一般分子量较大的属严紧型。分子量较小的属松弛型。的复制有时和它们的宿主细胞有关,某些在大肠杆菌内的复制属严紧型,而在变形杆菌内则属松弛型。
培养
在基因工程中,常用人工构建的作为载体。人工构建的可以集多种有用的特征于一体,如含多种单一酶切位点、抗生素耐药性等。常用的人工运载体有pBR322、pSC101。pBR322含有抗四环素基因(Tcr)和抗氨苄青霉素基因(Apr),并含有5种内切酶的单一切点。如果将DNA片段插入EcoRI切点,不会影响两个抗生素基因的表达。但是如果将DNA片段插入到Hind III、Bam H I 或 Sal I切点,就会使抗四环素基因失活。这时,含有DNA插入片段的pBR322将使宿主细菌抗氨苄青霉素,但对四环素敏感。没有DNA插入片段的pBR322会使宿主细菌既抗氨苄青霉素又抗四环素,而没有pBR322的细菌将对氨苄青霉素和四环素都敏感。pSC101与pBR322相似,只是没有抗氨苄青霉素基因和PstI切点。运载体的zui大插入片段约为10 kb(kb表示为千碱基对)。
1973年,科学家将作为基因的载体使用,为基因工程的诞生奠定了基础。
zui常用的是大肠杆菌的。这种常含有抗生素抗性基因,例如,卡那霉素抗性基因。
pBR322
pBR322DNA分子的长度为4363bp,此载体中有两个标记基因,一个是氨苄青霉素抗性基因(Apr),另一个是四环素抗性基因(Tetr)。现在已知pBR322DNA分子共有24种核酸内切限制酶的单一识别位点。其中7种限制酶(从12:00位置按顺时针方向)即EcoRV、NheI、BamHI、SphI、SalI、XmaIII和NruI的识别位点位于四环素抗性基因内部,另
外有2 种限制酶即ClaI和HindIII的识别位点是存在于这个基因的启动区内,在这9个限制位点上插入外源DNA都会导致tetr的失活。3种限制酶即ScaI、PvuI和PstI的识别位点位于氨苄青霉素抗性基因内,在这些位点插入外源DNA则会导致ampr基因的失活。由pBR322载体的结构可知其具有如下优点:(1)具有较小的分子量。经验表明,为了避免在DNA的纯化过程中发生链的断裂,克隆载体的分子大小不要超过10Kb。pBR322这种小分子量的特点,不仅易于自身DNA的纯化,而且可容纳较大的外源DNA片段;(2)具有两种抗菌素抗性基因可供作转化子的选择记号,能指示载体或重组DNA分子是否进入宿主细胞以及外源DNA分子是否插入载体分子形成了重组子。标记基因往往可以赋予宿主细胞一种新的表型,这种转化细胞可明显地区别于非转化细胞。当我们把一个DNA片段插入到某一个标记基因内时,该基因就失去了相应的功能。当把这种重组DNA分子转到宿主细胞后,该基因原来赋予的表型也就消失了。要是仍保留了原来表型的转化细胞,细胞内含有的DNA分子一定不是重组子。很显然,既要指示外源DNA是否进入了宿主细胞,又要指示载体DNA分子中是否插入了外源DNA片段,那么这种载体必须至少具有两个标记基因。另外,pBR322载体还具较高的拷贝数,而且经过氯霉素扩增之后,每个细胞中可积累1000~3000个拷贝,这就为重组体DNA的制备提供了极大的方便。
pBR322载体的构建
pBR322载体的构建过程可简单地概括如下:
1、由于pBR322的亲本之一是pMB1,故首先以pMB1为基础,引入Rldrd19的Tn3易位子,得到13.3kb的pMB3;
2、pMB3的分子量显然使得它不适合作为载体,所以要通过在EcoRI活性条件下的消化让它大部分的无用片段失去,留下来的小片段的DNA的黏性末端连接起来后就形成了pMB8(2.6kb);
3、此时,另外一种pSC101在EcoRI活性条件下消化产生了含有tetr抗性的DNA片断,这个片断和pMB8整合在一起就形成了pMB9(5.3kb)。此时pMB9为ampstetr表型;
4、pMB9已经初步具备载体的功能,为了让它更加完善,我们要让它具备amprtetr性能,即在pMB9上引入pSF2124的Tn3易位子,但Tn3可以来也可以走,为了留住它,我们切去了Tn3中表达转位酶的基因,形成了pBR313。
此后我们兵分两路:一路把pBR313的PstI位点除去,使之成为ampstetr表型的pBR318;
5、;另一路把pBR313的EcoRII的位点切除,使之成为amprtets表形的pBR320。
由此我们的到了两种功能互补的,这样我们只要将他们杂交就可以得到一种接近的载体了,这就是pBR322 。
pBR322的应用
了解了pBR322的结构和它的构建过程之后,我们来看pBR322在基因工程中的应用。
pBR322作为一种常用的基因克隆载体,在实际应用中有着非常重要的地位,其中一个突出的例子就是应用pBR322 作为克隆载体对水稻的叶绿体光诱导基因psbA 进行结构分析。
将水稻叶绿体的DNA,用EcoRI核酸限制性内切酶消化之后,放入含有溴化乙锭的低熔点(LMP)的1%琼脂糖凝胶中作电泳分离。从LMP中分离出分子大小为1.8~2.5kb之间的DNA片段,再与同样经过了EcoRI核酸限制性内切酶切割并用碱性磷酸酶作了脱磷酸处理的pBR322连接。然后,将混合物转化到大肠杆菌5346菌株,培养在氨苄青霉素选择平板上,形成Ampr转化子菌落群体。这样就构成了由EcoRI核酸限制性内切酶切割的水稻叶绿体DNA基因组库。用Ampr转化子菌落与32P放射性标记的玉米psbA DNA 探针作菌落杂交,可以分离出其中的阳性克隆体。从这些阳性克隆体中分离出来的重组体DNA,经过进一步的分析,就能测出水稻叶绿体基因psbA的序列。
利用pBR322作为载体重组人体的抑生长激素也是一个经常提到的应用例子。其过程和水稻叶绿体基因重组大同小异,只是除了在载体上插入抑生长激素基因外,还将含有lac操纵子起始部分的片段(包括启动子、操纵区、核糖体结合位点和β-半乳糖苷酶的主要部分)插在抑生长激素基因的旁边。由于有了lac操纵子的控制,重组基因产生的蛋白质的调节就变得比较容易了。